Impulsó la creación de Ceit el año 1982. Ambas entidades conviven en el Campus de San Sebastián de la Universidad de Navarra y mantienen una estrecha colaboración. Ceit ofrece a los estudiantes de ingeniería y doctorandos de Tecnun un entorno en el que realizar una investigación aplicada de referencia a nivel mundial. Por otra parte, Tecnun representa para Ceit una oportunidad única para conocer a los jóvenes ingenieros mejor cualificados.

Ceit es miembro de Innobasque (Agencia Vasca de la Innovación), que es una asociación privada, con fuerte respaldo público, creada para coordinar e impulsar la innovación en el País Vasco y fomentar el espíritu emprendedor y la creatividad.

Ceit colabora con el Cluster de Energías Renovables y Eficiencia Energética, creado por Fomento de San Sebastián a finales del año 2008. Sus objetivos consisten en el desarrollo económico de la ciudad y la mejora de la calidad de vida de sus ciudadanos. El Cluster es un punto de encuentro entre empresas, centro tecnológicos, centros de formación, asociaciones, entidades financieras e instituciones sectoriales.

Biodonostia, centro de referencia a nivel nacional e internacional en investigación sanitaria, ubicado en Donostia-San Sebastián, potencia de manera preferente la investigación traslacional. Apuesta por la innovación en tecnologías médicas y sanitarias, que revierten en una mejora en la asistencia sanitaria. Al mismo tiempo, generan riqueza para el país al convertir las invenciones en producto. Ceit colabora con Biodonostia y OSI Donostialdea a través de proyectos de Ingeniería Biomédica desarrollados de modo conjunto.

El Concytec es la institución rectora del Sistema Nacional de Ciencia y Tecnología e Innovación Tecnológica, SINACYT, integrada por la Academia, los Institutos de Investigación del Estado, las organizaciones empresariales, las comunidades y la sociedad civil. Ceit está autorizado como Centro de Investigación Científica y Desarrollo Tecnológico no Domiciliado en el marco de la Ley Nº 30309 (Formato nº 2), en la disciplina de Ingeniería de los Materiales, de la sub área de Ingeniería de los Materiales y del área de Ingenierías y Tecnologías.